Modelos evolutivos

Son una serie de modelos Markov para secuencias de ADN evolutivo. Esto se debe a que los procesos evolutivos varían entre genomas y entre diferentes regiones del genoma, por ejemplo diferentes procesos evolutivos aplican para regiones con código y sin código. Estos modelos difieren en su mayoría en la parametrización del tipo de matriz y en los modelos del tipo de variación. Modelos de ADN evolutivo: JC69 modelo (Jukes y Cantor, 1969), K80 modelo (Kimura, 1980), F81 modelo (Felsenstein 1981), HKY85 modelo (Hasegawa, Kishino y Yano 1985), T92 modelo (Tamura 1992), TN93 modelo (Tamura y Nei 1993) y RGT: Reversible en el Tiempo Generalisada.